Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSRP1Q08945 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SSRP1Q08945 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSRP1Q08945 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSRP1Q08945 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SSRP1Q08945 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SSRP1Q08945 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SSRP1Q08945 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSRP1Q08945 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SSRP1Q08945 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SSRP1Q08945 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SSRP1Q08945 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SSRP1Q08945 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SSRP1Q08945 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSRP1Q08945 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSRP1Q08945 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SSRP1Q08945 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSRP1Q08945 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSRP1Q08945 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SSRP1Q08945 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SSRP1Q08945 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SSRP1Q08945 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SSRP1Q08945 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SSRP1Q08945 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SSRP1Q08945 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SSRP1Q08945 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SSRP1Q08945 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SSRP1Q08945 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SSRP1Q08945 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SSRP1Q08945 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SSRP1Q08945 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SSRP1Q08945 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SSRP1Q08945 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SSRP1Q08945 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SSRP1Q08945 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SSRP1Q08945 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SSRP1Q08945 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SSRP1Q08945 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SSRP1Q08945 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SSRP1Q08945 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SSRP1Q08945 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SSRP1Q08945 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SSRP1Q08945 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SSRP1Q08945 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SSRP1Q08945 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SSRP1Q08945 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SSRP1Q08945 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SSRP1Q08945 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SSRP1Q08945 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SSRP1Q08945 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SSRP1Q08945 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SSRP1Q08945 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SSRP1Q08945 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SSRP1Q08945 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SSRP1Q08945 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SSRP1Q08945 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SSRP1Q08945 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SSRP1Q08945 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SSRP1Q08945 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SSRP1Q08945 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SSRP1Q08945 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SSRP1Q08945 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SSRP1Q08945 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SSRP1Q08945 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SSRP1Q08945 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SSRP1Q08945 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SSRP1Q08945 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SSRP1Q08945 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SSRP1Q08945 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SSRP1Q08945 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SSRP1Q08945 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SSRP1Q08945 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SSRP1Q08945 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SSRP1Q08945 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SSRP1Q08945 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SSRP1Q08945 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SSRP1Q08945 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SSRP1Q08945 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SSRP1Q08945 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms