Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDE4DQ08499 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms