Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
POLEQ07864 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
POLEQ07864 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
POLEQ07864 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
POLEQ07864 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
POLEQ07864 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
POLEQ07864 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
POLEQ07864 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLEQ07864 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLEQ07864 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
POLEQ07864 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLEQ07864 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLEQ07864 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLEQ07864 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLEQ07864 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLEQ07864 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLEQ07864 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLEQ07864 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLEQ07864 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLEQ07864 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLEQ07864 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLEQ07864 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLEQ07864 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLEQ07864 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLEQ07864 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLEQ07864 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLEQ07864 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLEQ07864 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLEQ07864 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLEQ07864 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLEQ07864 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLEQ07864 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLEQ07864 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLEQ07864 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLEQ07864 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLEQ07864 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
POLEQ07864 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLEQ07864 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLEQ07864 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLEQ07864 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
POLEQ07864 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLEQ07864 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLEQ07864 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLEQ07864 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLEQ07864 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLEQ07864 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLEQ07864 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLEQ07864 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLEQ07864 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLEQ07864 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLEQ07864 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLEQ07864 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
POLEQ07864 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLEQ07864 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLEQ07864 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLEQ07864 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLEQ07864 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLEQ07864 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
POLEQ07864 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLEQ07864 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLEQ07864 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLEQ07864 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
POLEQ07864 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLEQ07864 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLEQ07864 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLEQ07864 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLEQ07864 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLEQ07864 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLEQ07864 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLEQ07864 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLEQ07864 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLEQ07864 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLEQ07864 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLEQ07864 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLEQ07864 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLEQ07864 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLEQ07864 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLEQ07864 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
POLEQ07864 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLEQ07864 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLEQ07864 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
POLEQ07864 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
POLEQ07864 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
POLEQ07864 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
POLEQ07864 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
POLEQ07864 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
POLEQ07864 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
POLEQ07864 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
POLEQ07864 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLEQ07864 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLEQ07864 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLEQ07864 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLEQ07864 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLEQ07864 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLEQ07864 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLEQ07864 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLEQ07864 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLEQ07864 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
POLEQ07864 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
POLEQ07864 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms