Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TFF3Q07654 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFF3Q07654 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms