Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LTBQ06643 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LTBQ06643 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LTBQ06643 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LTBQ06643 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LTBQ06643 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LTBQ06643 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LTBQ06643 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LTBQ06643 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LTBQ06643 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LTBQ06643 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LTBQ06643 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LTBQ06643 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LTBQ06643 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LTBQ06643 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LTBQ06643 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LTBQ06643 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LTBQ06643 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LTBQ06643 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LTBQ06643 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LTBQ06643 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LTBQ06643 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LTBQ06643 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LTBQ06643 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LTBQ06643 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LTBQ06643 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LTBQ06643 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LTBQ06643 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LTBQ06643 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LTBQ06643 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LTBQ06643 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LTBQ06643 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LTBQ06643 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LTBQ06643 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LTBQ06643 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LTBQ06643 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LTBQ06643 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LTBQ06643 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LTBQ06643 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LTBQ06643 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LTBQ06643 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LTBQ06643 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LTBQ06643 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LTBQ06643 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LTBQ06643 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LTBQ06643 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LTBQ06643 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LTBQ06643 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LTBQ06643 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LTBQ06643 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LTBQ06643 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LTBQ06643 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LTBQ06643 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LTBQ06643 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LTBQ06643 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LTBQ06643 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LTBQ06643 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LTBQ06643 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LTBQ06643 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LTBQ06643 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LTBQ06643 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LTBQ06643 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LTBQ06643 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LTBQ06643 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LTBQ06643 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LTBQ06643 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LTBQ06643 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LTBQ06643 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LTBQ06643 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LTBQ06643 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LTBQ06643 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LTBQ06643 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LTBQ06643 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LTBQ06643 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LTBQ06643 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LTBQ06643 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LTBQ06643 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LTBQ06643 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LTBQ06643 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LTBQ06643 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LTBQ06643 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LTBQ06643 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LTBQ06643 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LTBQ06643 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LTBQ06643 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LTBQ06643 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LTBQ06643 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LTBQ06643 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LTBQ06643 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LTBQ06643 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LTBQ06643 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LTBQ06643 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LTBQ06643 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LTBQ06643 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LTBQ06643 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LTBQ06643 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LTBQ06643 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LTBQ06643 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LTBQ06643 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LTBQ06643 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms