Protein–RNA interactions for Protein: Q06455

RUNX1T1, Protein CBFA2T1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1T1Q06455 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RUNX1T1Q06455 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RUNX1T1Q06455 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RUNX1T1Q06455 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RUNX1T1Q06455 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RUNX1T1Q06455 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RUNX1T1Q06455 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RUNX1T1Q06455 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RUNX1T1Q06455 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RUNX1T1Q06455 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX1T1Q06455 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX1T1Q06455 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX1T1Q06455 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX1T1Q06455 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX1T1Q06455 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX1T1Q06455 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX1T1Q06455 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX1T1Q06455 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX1T1Q06455 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX1T1Q06455 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX1T1Q06455 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX1T1Q06455 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX1T1Q06455 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX1T1Q06455 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX1T1Q06455 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX1T1Q06455 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX1T1Q06455 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX1T1Q06455 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX1T1Q06455 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX1T1Q06455 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX1T1Q06455 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX1T1Q06455 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX1T1Q06455 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX1T1Q06455 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX1T1Q06455 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX1T1Q06455 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RUNX1T1Q06455 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms