Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CACNG1Q06432 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNG1Q06432 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms