Protein–RNA interactions for Protein: Q06418

TYRO3, Tyrosine-protein kinase receptor TYRO3, humanhuman

Predictions only

Length 890 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYRO3Q06418 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TYRO3Q06418 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TYRO3Q06418 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TYRO3Q06418 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TYRO3Q06418 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TYRO3Q06418 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TYRO3Q06418 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TYRO3Q06418 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TYRO3Q06418 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TYRO3Q06418 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TYRO3Q06418 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TYRO3Q06418 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TYRO3Q06418 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
TYRO3Q06418 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TYRO3Q06418 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
TYRO3Q06418 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TYRO3Q06418 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TYRO3Q06418 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TYRO3Q06418 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
TYRO3Q06418 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TYRO3Q06418 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TYRO3Q06418 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TYRO3Q06418 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
TYRO3Q06418 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TYRO3Q06418 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TYRO3Q06418 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
TYRO3Q06418 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TYRO3Q06418 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TYRO3Q06418 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TYRO3Q06418 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TYRO3Q06418 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
TYRO3Q06418 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TYRO3Q06418 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TYRO3Q06418 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TYRO3Q06418 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TYRO3Q06418 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TYRO3Q06418 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TYRO3Q06418 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TYRO3Q06418 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TYRO3Q06418 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TYRO3Q06418 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TYRO3Q06418 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TYRO3Q06418 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TYRO3Q06418 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TYRO3Q06418 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TYRO3Q06418 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TYRO3Q06418 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TYRO3Q06418 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TYRO3Q06418 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TYRO3Q06418 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TYRO3Q06418 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TYRO3Q06418 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TYRO3Q06418 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TYRO3Q06418 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TYRO3Q06418 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TYRO3Q06418 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TYRO3Q06418 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TYRO3Q06418 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TYRO3Q06418 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TYRO3Q06418 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TYRO3Q06418 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TYRO3Q06418 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TYRO3Q06418 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TYRO3Q06418 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TYRO3Q06418 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TYRO3Q06418 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TYRO3Q06418 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TYRO3Q06418 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TYRO3Q06418 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TYRO3Q06418 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TYRO3Q06418 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TYRO3Q06418 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TYRO3Q06418 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TYRO3Q06418 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TYRO3Q06418 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TYRO3Q06418 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TYRO3Q06418 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TYRO3Q06418 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TYRO3Q06418 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TYRO3Q06418 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TYRO3Q06418 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TYRO3Q06418 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TYRO3Q06418 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TYRO3Q06418 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TYRO3Q06418 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TYRO3Q06418 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TYRO3Q06418 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TYRO3Q06418 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TYRO3Q06418 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TYRO3Q06418 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TYRO3Q06418 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TYRO3Q06418 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TYRO3Q06418 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TYRO3Q06418 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TYRO3Q06418 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TYRO3Q06418 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TYRO3Q06418 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TYRO3Q06418 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TYRO3Q06418 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TYRO3Q06418 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms