Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CTDSPL2Q05D32 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms