Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms