Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPARDQ03181 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPARDQ03181 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPARDQ03181 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPARDQ03181 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPARDQ03181 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPARDQ03181 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPARDQ03181 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPARDQ03181 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPARDQ03181 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPARDQ03181 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPARDQ03181 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPARDQ03181 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPARDQ03181 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPARDQ03181 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPARDQ03181 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPARDQ03181 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPARDQ03181 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PPARDQ03181 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPARDQ03181 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPARDQ03181 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPARDQ03181 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPARDQ03181 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PPARDQ03181 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPARDQ03181 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPARDQ03181 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPARDQ03181 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPARDQ03181 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPARDQ03181 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPARDQ03181 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPARDQ03181 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPARDQ03181 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPARDQ03181 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPARDQ03181 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPARDQ03181 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPARDQ03181 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPARDQ03181 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPARDQ03181 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPARDQ03181 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPARDQ03181 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPARDQ03181 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPARDQ03181 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPARDQ03181 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPARDQ03181 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PPARDQ03181 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PPARDQ03181 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPARDQ03181 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPARDQ03181 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPARDQ03181 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPARDQ03181 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPARDQ03181 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPARDQ03181 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPARDQ03181 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPARDQ03181 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPARDQ03181 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPARDQ03181 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PPARDQ03181 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PPARDQ03181 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PPARDQ03181 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PPARDQ03181 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PPARDQ03181 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PPARDQ03181 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PPARDQ03181 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PPARDQ03181 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PPARDQ03181 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PPARDQ03181 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PPARDQ03181 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PPARDQ03181 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PPARDQ03181 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PPARDQ03181 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PPARDQ03181 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PPARDQ03181 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PPARDQ03181 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PPARDQ03181 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PPARDQ03181 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PPARDQ03181 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PPARDQ03181 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PPARDQ03181 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms