Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CREMQ03060 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CREMQ03060 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CREMQ03060 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CREMQ03060 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CREMQ03060 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CREMQ03060 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CREMQ03060 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CREMQ03060 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CREMQ03060 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CREMQ03060 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CREMQ03060 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CREMQ03060 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CREMQ03060 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CREMQ03060 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CREMQ03060 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CREMQ03060 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CREMQ03060 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CREMQ03060 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CREMQ03060 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CREMQ03060 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CREMQ03060 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CREMQ03060 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CREMQ03060 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CREMQ03060 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CREMQ03060 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CREMQ03060 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CREMQ03060 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CREMQ03060 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CREMQ03060 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CREMQ03060 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CREMQ03060 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CREMQ03060 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CREMQ03060 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CREMQ03060 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CREMQ03060 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CREMQ03060 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CREMQ03060 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CREMQ03060 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CREMQ03060 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CREMQ03060 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CREMQ03060 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CREMQ03060 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CREMQ03060 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CREMQ03060 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CREMQ03060 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CREMQ03060 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CREMQ03060 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CREMQ03060 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CREMQ03060 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CREMQ03060 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CREMQ03060 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CREMQ03060 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CREMQ03060 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CREMQ03060 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CREMQ03060 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CREMQ03060 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CREMQ03060 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CREMQ03060 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CREMQ03060 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CREMQ03060 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CREMQ03060 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CREMQ03060 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CREMQ03060 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CREMQ03060 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CREMQ03060 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CREMQ03060 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CREMQ03060 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CREMQ03060 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CREMQ03060 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CREMQ03060 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CREMQ03060 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CREMQ03060 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CREMQ03060 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CREMQ03060 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CREMQ03060 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CREMQ03060 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CREMQ03060 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CREMQ03060 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CREMQ03060 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CREMQ03060 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CREMQ03060 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CREMQ03060 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CREMQ03060 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CREMQ03060 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CREMQ03060 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CREMQ03060 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CREMQ03060 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CREMQ03060 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CREMQ03060 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CREMQ03060 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CREMQ03060 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CREMQ03060 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CREMQ03060 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CREMQ03060 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CREMQ03060 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CREMQ03060 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CREMQ03060 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CREMQ03060 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CREMQ03060 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms