Protein–RNA interactions for Protein: Q02928

CYP4A11, Cytochrome P450 4A11, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A11Q02928 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYP4A11Q02928 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYP4A11Q02928 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYP4A11Q02928 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYP4A11Q02928 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYP4A11Q02928 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYP4A11Q02928 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYP4A11Q02928 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYP4A11Q02928 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYP4A11Q02928 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYP4A11Q02928 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYP4A11Q02928 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CYP4A11Q02928 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYP4A11Q02928 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYP4A11Q02928 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYP4A11Q02928 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYP4A11Q02928 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYP4A11Q02928 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYP4A11Q02928 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYP4A11Q02928 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYP4A11Q02928 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYP4A11Q02928 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CYP4A11Q02928 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CYP4A11Q02928 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYP4A11Q02928 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYP4A11Q02928 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYP4A11Q02928 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CYP4A11Q02928 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms