Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DEFA6Q01524 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA6Q01524 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA6Q01524 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA6Q01524 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA6Q01524 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA6Q01524 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA6Q01524 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA6Q01524 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA6Q01524 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA6Q01524 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA6Q01524 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA6Q01524 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA6Q01524 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA6Q01524 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA6Q01524 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA6Q01524 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA6Q01524 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA6Q01524 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA6Q01524 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DEFA6Q01524 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA6Q01524 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA6Q01524 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA6Q01524 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DEFA6Q01524 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA6Q01524 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA6Q01524 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA6Q01524 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA6Q01524 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA6Q01524 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA6Q01524 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA6Q01524 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA6Q01524 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DEFA6Q01524 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DEFA6Q01524 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DEFA6Q01524 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA6Q01524 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA6Q01524 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA6Q01524 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA6Q01524 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA6Q01524 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA6Q01524 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA6Q01524 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA6Q01524 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA6Q01524 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA6Q01524 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA6Q01524 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA6Q01524 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA6Q01524 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DEFA6Q01524 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA6Q01524 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DEFA6Q01524 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DEFA6Q01524 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DEFA6Q01524 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
DEFA6Q01524 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
DEFA6Q01524 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DEFA6Q01524 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
DEFA6Q01524 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DEFA6Q01524 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DEFA6Q01524 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DEFA6Q01524 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DEFA6Q01524 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DEFA6Q01524 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DEFA6Q01524 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DEFA6Q01524 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC15.05■□□□□ -0
DEFA6Q01524 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
DEFA6Q01524 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
DEFA6Q01524 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.05■□□□□ -0
DEFA6Q01524 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DEFA6Q01524 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
DEFA6Q01524 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.05■□□□□ -0
DEFA6Q01524 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DEFA6Q01524 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DEFA6Q01524 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DEFA6Q01524 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DEFA6Q01524 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DEFA6Q01524 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DEFA6Q01524 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DEFA6Q01524 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DEFA6Q01524 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DEFA6Q01524 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DEFA6Q01524 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DEFA6Q01524 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DEFA6Q01524 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DEFA6Q01524 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DEFA6Q01524 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DEFA6Q01524 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DEFA6Q01524 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DEFA6Q01524 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DEFA6Q01524 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DEFA6Q01524 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DEFA6Q01524 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DEFA6Q01524 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DEFA6Q01524 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DEFA6Q01524 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DEFA6Q01524 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DEFA6Q01524 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DEFA6Q01524 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DEFA6Q01524 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DEFA6Q01524 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms