Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CDC42EP1Q00587 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms