Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CDK6Q00534 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDK6Q00534 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms