Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIM1P81133 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIM1P81133 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SIM1P81133 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SIM1P81133 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIM1P81133 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIM1P81133 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIM1P81133 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIM1P81133 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SIM1P81133 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SIM1P81133 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIM1P81133 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SIM1P81133 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SIM1P81133 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SIM1P81133 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIM1P81133 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIM1P81133 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIM1P81133 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIM1P81133 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIM1P81133 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SIM1P81133 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIM1P81133 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIM1P81133 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIM1P81133 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIM1P81133 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIM1P81133 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIM1P81133 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIM1P81133 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIM1P81133 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIM1P81133 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIM1P81133 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIM1P81133 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIM1P81133 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIM1P81133 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SIM1P81133 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SIM1P81133 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SIM1P81133 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SIM1P81133 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SIM1P81133 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SIM1P81133 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SIM1P81133 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SIM1P81133 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SIM1P81133 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SIM1P81133 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SIM1P81133 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SIM1P81133 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SIM1P81133 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SIM1P81133 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SIM1P81133 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SIM1P81133 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SIM1P81133 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SIM1P81133 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SIM1P81133 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SIM1P81133 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SIM1P81133 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SIM1P81133 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SIM1P81133 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SIM1P81133 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SIM1P81133 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SIM1P81133 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SIM1P81133 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SIM1P81133 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SIM1P81133 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SIM1P81133 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SIM1P81133 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SIM1P81133 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SIM1P81133 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIM1P81133 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIM1P81133 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIM1P81133 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIM1P81133 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIM1P81133 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIM1P81133 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIM1P81133 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIM1P81133 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIM1P81133 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIM1P81133 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIM1P81133 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIM1P81133 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIM1P81133 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIM1P81133 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SIM1P81133 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIM1P81133 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIM1P81133 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIM1P81133 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIM1P81133 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIM1P81133 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIM1P81133 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIM1P81133 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIM1P81133 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIM1P81133 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIM1P81133 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIM1P81133 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIM1P81133 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIM1P81133 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIM1P81133 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIM1P81133 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIM1P81133 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIM1P81133 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIM1P81133 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms