Protein–RNA interactions for Protein: P80075

CCL8, C-C motif chemokine 8, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL8P80075 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL8P80075 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL8P80075 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL8P80075 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL8P80075 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL8P80075 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL8P80075 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL8P80075 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL8P80075 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL8P80075 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL8P80075 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL8P80075 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL8P80075 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL8P80075 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL8P80075 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL8P80075 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL8P80075 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL8P80075 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL8P80075 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL8P80075 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL8P80075 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL8P80075 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL8P80075 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL8P80075 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL8P80075 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL8P80075 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL8P80075 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL8P80075 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL8P80075 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL8P80075 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL8P80075 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL8P80075 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL8P80075 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL8P80075 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL8P80075 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL8P80075 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL8P80075 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL8P80075 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL8P80075 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL8P80075 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL8P80075 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL8P80075 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL8P80075 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL8P80075 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL8P80075 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL8P80075 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL8P80075 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL8P80075 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL8P80075 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL8P80075 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL8P80075 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL8P80075 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL8P80075 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL8P80075 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL8P80075 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL8P80075 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL8P80075 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL8P80075 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL8P80075 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL8P80075 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL8P80075 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL8P80075 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL8P80075 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL8P80075 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL8P80075 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL8P80075 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL8P80075 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL8P80075 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL8P80075 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL8P80075 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL8P80075 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL8P80075 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL8P80075 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL8P80075 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL8P80075 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL8P80075 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL8P80075 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL8P80075 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL8P80075 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL8P80075 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL8P80075 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL8P80075 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL8P80075 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL8P80075 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL8P80075 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL8P80075 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL8P80075 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL8P80075 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL8P80075 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL8P80075 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL8P80075 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL8P80075 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL8P80075 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL8P80075 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL8P80075 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL8P80075 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL8P80075 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL8P80075 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL8P80075 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL8P80075 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms