Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NME5P56597 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NME5P56597 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NME5P56597 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NME5P56597 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NME5P56597 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NME5P56597 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NME5P56597 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NME5P56597 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NME5P56597 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NME5P56597 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NME5P56597 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NME5P56597 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NME5P56597 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NME5P56597 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NME5P56597 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NME5P56597 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NME5P56597 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NME5P56597 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NME5P56597 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NME5P56597 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NME5P56597 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NME5P56597 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NME5P56597 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NME5P56597 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NME5P56597 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NME5P56597 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NME5P56597 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NME5P56597 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NME5P56597 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NME5P56597 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NME5P56597 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NME5P56597 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NME5P56597 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NME5P56597 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NME5P56597 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NME5P56597 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NME5P56597 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NME5P56597 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NME5P56597 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NME5P56597 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NME5P56597 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NME5P56597 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NME5P56597 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NME5P56597 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NME5P56597 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NME5P56597 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NME5P56597 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NME5P56597 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NME5P56597 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NME5P56597 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NME5P56597 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NME5P56597 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NME5P56597 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NME5P56597 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NME5P56597 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NME5P56597 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NME5P56597 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NME5P56597 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NME5P56597 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NME5P56597 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NME5P56597 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NME5P56597 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NME5P56597 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NME5P56597 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NME5P56597 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NME5P56597 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NME5P56597 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NME5P56597 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NME5P56597 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NME5P56597 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NME5P56597 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NME5P56597 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NME5P56597 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NME5P56597 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NME5P56597 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NME5P56597 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NME5P56597 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NME5P56597 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NME5P56597 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NME5P56597 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NME5P56597 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NME5P56597 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NME5P56597 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NME5P56597 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NME5P56597 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NME5P56597 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NME5P56597 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NME5P56597 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NME5P56597 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NME5P56597 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NME5P56597 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NME5P56597 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NME5P56597 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NME5P56597 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NME5P56597 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NME5P56597 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NME5P56597 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NME5P56597 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NME5P56597 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms