Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms