Protein–RNA interactions for Protein: P53396

ACLY, ATP-citrate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACLYP53396 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACLYP53396 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACLYP53396 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACLYP53396 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACLYP53396 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ACLYP53396 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACLYP53396 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACLYP53396 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACLYP53396 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACLYP53396 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ACLYP53396 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACLYP53396 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACLYP53396 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ACLYP53396 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACLYP53396 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACLYP53396 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACLYP53396 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACLYP53396 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACLYP53396 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACLYP53396 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACLYP53396 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACLYP53396 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACLYP53396 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACLYP53396 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACLYP53396 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACLYP53396 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACLYP53396 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACLYP53396 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACLYP53396 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACLYP53396 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ACLYP53396 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACLYP53396 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACLYP53396 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACLYP53396 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ACLYP53396 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACLYP53396 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACLYP53396 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACLYP53396 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACLYP53396 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACLYP53396 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACLYP53396 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ACLYP53396 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACLYP53396 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACLYP53396 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACLYP53396 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACLYP53396 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACLYP53396 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACLYP53396 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACLYP53396 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACLYP53396 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACLYP53396 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACLYP53396 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACLYP53396 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ACLYP53396 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACLYP53396 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACLYP53396 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACLYP53396 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACLYP53396 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACLYP53396 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACLYP53396 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACLYP53396 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACLYP53396 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACLYP53396 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACLYP53396 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACLYP53396 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACLYP53396 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACLYP53396 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACLYP53396 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACLYP53396 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACLYP53396 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACLYP53396 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACLYP53396 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ACLYP53396 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACLYP53396 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACLYP53396 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACLYP53396 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACLYP53396 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACLYP53396 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ACLYP53396 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACLYP53396 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ACLYP53396 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ACLYP53396 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ACLYP53396 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACLYP53396 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACLYP53396 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACLYP53396 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACLYP53396 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACLYP53396 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACLYP53396 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACLYP53396 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACLYP53396 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACLYP53396 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACLYP53396 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ACLYP53396 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ACLYP53396 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ACLYP53396 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ACLYP53396 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACLYP53396 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACLYP53396 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACLYP53396 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.3 ms