Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSRP3P50461 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSRP3P50461 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSRP3P50461 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSRP3P50461 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSRP3P50461 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CSRP3P50461 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSRP3P50461 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSRP3P50461 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSRP3P50461 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSRP3P50461 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSRP3P50461 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSRP3P50461 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSRP3P50461 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSRP3P50461 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSRP3P50461 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSRP3P50461 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSRP3P50461 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSRP3P50461 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSRP3P50461 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSRP3P50461 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSRP3P50461 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CSRP3P50461 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSRP3P50461 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSRP3P50461 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSRP3P50461 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSRP3P50461 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSRP3P50461 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSRP3P50461 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSRP3P50461 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CSRP3P50461 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSRP3P50461 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSRP3P50461 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSRP3P50461 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSRP3P50461 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSRP3P50461 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSRP3P50461 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSRP3P50461 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSRP3P50461 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSRP3P50461 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CSRP3P50461 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSRP3P50461 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSRP3P50461 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSRP3P50461 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSRP3P50461 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSRP3P50461 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CSRP3P50461 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSRP3P50461 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CSRP3P50461 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSRP3P50461 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSRP3P50461 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSRP3P50461 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSRP3P50461 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSRP3P50461 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSRP3P50461 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSRP3P50461 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSRP3P50461 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CSRP3P50461 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSRP3P50461 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSRP3P50461 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSRP3P50461 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSRP3P50461 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSRP3P50461 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSRP3P50461 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSRP3P50461 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSRP3P50461 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSRP3P50461 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSRP3P50461 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSRP3P50461 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSRP3P50461 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSRP3P50461 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSRP3P50461 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSRP3P50461 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CSRP3P50461 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSRP3P50461 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSRP3P50461 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CSRP3P50461 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSRP3P50461 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSRP3P50461 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSRP3P50461 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSRP3P50461 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CSRP3P50461 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSRP3P50461 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSRP3P50461 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSRP3P50461 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSRP3P50461 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSRP3P50461 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSRP3P50461 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CSRP3P50461 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSRP3P50461 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSRP3P50461 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSRP3P50461 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CSRP3P50461 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSRP3P50461 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSRP3P50461 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSRP3P50461 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSRP3P50461 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSRP3P50461 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSRP3P50461 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSRP3P50461 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms