Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRE11P49959 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRE11P49959 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRE11P49959 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRE11P49959 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRE11P49959 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRE11P49959 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRE11P49959 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRE11P49959 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRE11P49959 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRE11P49959 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRE11P49959 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MRE11P49959 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRE11P49959 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRE11P49959 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRE11P49959 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRE11P49959 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRE11P49959 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRE11P49959 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRE11P49959 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRE11P49959 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRE11P49959 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRE11P49959 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRE11P49959 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRE11P49959 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRE11P49959 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRE11P49959 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRE11P49959 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRE11P49959 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRE11P49959 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRE11P49959 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRE11P49959 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRE11P49959 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRE11P49959 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRE11P49959 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRE11P49959 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRE11P49959 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRE11P49959 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRE11P49959 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRE11P49959 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRE11P49959 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRE11P49959 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRE11P49959 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MRE11P49959 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MRE11P49959 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRE11P49959 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRE11P49959 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRE11P49959 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRE11P49959 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRE11P49959 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRE11P49959 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRE11P49959 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRE11P49959 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRE11P49959 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRE11P49959 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRE11P49959 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRE11P49959 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRE11P49959 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRE11P49959 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRE11P49959 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRE11P49959 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MRE11P49959 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRE11P49959 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRE11P49959 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRE11P49959 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRE11P49959 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRE11P49959 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRE11P49959 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRE11P49959 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRE11P49959 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRE11P49959 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MRE11P49959 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRE11P49959 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRE11P49959 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRE11P49959 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MRE11P49959 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRE11P49959 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRE11P49959 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRE11P49959 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRE11P49959 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRE11P49959 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRE11P49959 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRE11P49959 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRE11P49959 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRE11P49959 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRE11P49959 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MRE11P49959 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MRE11P49959 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRE11P49959 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MRE11P49959 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRE11P49959 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRE11P49959 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRE11P49959 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRE11P49959 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRE11P49959 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRE11P49959 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRE11P49959 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRE11P49959 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRE11P49959 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MRE11P49959 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms