Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CASP4P49662 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CASP4P49662 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CASP4P49662 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASP4P49662 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASP4P49662 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASP4P49662 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASP4P49662 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASP4P49662 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASP4P49662 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASP4P49662 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASP4P49662 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CASP4P49662 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASP4P49662 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASP4P49662 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASP4P49662 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASP4P49662 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASP4P49662 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASP4P49662 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASP4P49662 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASP4P49662 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASP4P49662 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASP4P49662 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CASP4P49662 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CASP4P49662 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CASP4P49662 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASP4P49662 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASP4P49662 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CASP4P49662 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CASP4P49662 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CASP4P49662 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CASP4P49662 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CASP4P49662 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CASP4P49662 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CASP4P49662 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP4P49662 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP4P49662 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP4P49662 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP4P49662 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP4P49662 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP4P49662 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP4P49662 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP4P49662 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP4P49662 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP4P49662 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP4P49662 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP4P49662 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP4P49662 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP4P49662 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP4P49662 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP4P49662 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP4P49662 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP4P49662 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP4P49662 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP4P49662 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP4P49662 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP4P49662 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP4P49662 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
CASP4P49662 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CASP4P49662 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASP4P49662 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASP4P49662 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CASP4P49662 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASP4P49662 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASP4P49662 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CASP4P49662 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CASP4P49662 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CASP4P49662 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CASP4P49662 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASP4P49662 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASP4P49662 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASP4P49662 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASP4P49662 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASP4P49662 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASP4P49662 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CASP4P49662 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASP4P49662 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CASP4P49662 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CASP4P49662 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASP4P49662 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASP4P49662 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASP4P49662 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASP4P49662 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASP4P49662 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASP4P49662 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASP4P49662 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASP4P49662 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASP4P49662 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASP4P49662 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASP4P49662 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASP4P49662 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASP4P49662 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CASP4P49662 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CASP4P49662 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP4P49662 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP4P49662 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP4P49662 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP4P49662 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP4P49662 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP4P49662 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms