Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FNTAP49354 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FNTAP49354 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FNTAP49354 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FNTAP49354 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FNTAP49354 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FNTAP49354 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FNTAP49354 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FNTAP49354 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FNTAP49354 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FNTAP49354 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FNTAP49354 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FNTAP49354 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FNTAP49354 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FNTAP49354 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FNTAP49354 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FNTAP49354 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FNTAP49354 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FNTAP49354 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FNTAP49354 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FNTAP49354 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FNTAP49354 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FNTAP49354 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FNTAP49354 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FNTAP49354 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FNTAP49354 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FNTAP49354 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FNTAP49354 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FNTAP49354 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FNTAP49354 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FNTAP49354 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FNTAP49354 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FNTAP49354 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FNTAP49354 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FNTAP49354 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FNTAP49354 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FNTAP49354 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FNTAP49354 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FNTAP49354 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FNTAP49354 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FNTAP49354 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FNTAP49354 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FNTAP49354 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FNTAP49354 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
FNTAP49354 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FNTAP49354 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
FNTAP49354 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
FNTAP49354 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FNTAP49354 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FNTAP49354 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FNTAP49354 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FNTAP49354 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FNTAP49354 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FNTAP49354 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FNTAP49354 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FNTAP49354 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FNTAP49354 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
FNTAP49354 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FNTAP49354 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FNTAP49354 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FNTAP49354 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FNTAP49354 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FNTAP49354 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
FNTAP49354 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
FNTAP49354 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FNTAP49354 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FNTAP49354 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FNTAP49354 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FNTAP49354 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FNTAP49354 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
FNTAP49354 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FNTAP49354 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FNTAP49354 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FNTAP49354 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FNTAP49354 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FNTAP49354 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FNTAP49354 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FNTAP49354 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FNTAP49354 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FNTAP49354 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
FNTAP49354 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FNTAP49354 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FNTAP49354 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
FNTAP49354 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FNTAP49354 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FNTAP49354 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FNTAP49354 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FNTAP49354 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FNTAP49354 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
FNTAP49354 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
FNTAP49354 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FNTAP49354 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
FNTAP49354 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FNTAP49354 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FNTAP49354 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FNTAP49354 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FNTAP49354 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FNTAP49354 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
FNTAP49354 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FNTAP49354 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms