Protein–RNA interactions for Protein: P49335

POU3F4, POU domain, class 3, transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F4P49335 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
POU3F4P49335 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms