Protein–RNA interactions for Protein: P49189

ALDH9A1, 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH9A1P49189 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ALDH9A1P49189 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ALDH9A1P49189 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ALDH9A1P49189 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ALDH9A1P49189 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ALDH9A1P49189 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ALDH9A1P49189 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ALDH9A1P49189 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ALDH9A1P49189 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ALDH9A1P49189 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ALDH9A1P49189 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ALDH9A1P49189 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ALDH9A1P49189 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ALDH9A1P49189 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ALDH9A1P49189 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ALDH9A1P49189 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ALDH9A1P49189 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ALDH9A1P49189 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ALDH9A1P49189 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ALDH9A1P49189 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ALDH9A1P49189 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ALDH9A1P49189 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ALDH9A1P49189 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ALDH9A1P49189 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ALDH9A1P49189 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ALDH9A1P49189 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ALDH9A1P49189 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ALDH9A1P49189 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ALDH9A1P49189 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ALDH9A1P49189 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ALDH9A1P49189 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ALDH9A1P49189 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ALDH9A1P49189 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ALDH9A1P49189 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ALDH9A1P49189 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ALDH9A1P49189 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ALDH9A1P49189 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ALDH9A1P49189 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ALDH9A1P49189 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ALDH9A1P49189 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ALDH9A1P49189 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ALDH9A1P49189 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ALDH9A1P49189 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ALDH9A1P49189 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ALDH9A1P49189 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ALDH9A1P49189 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ALDH9A1P49189 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ALDH9A1P49189 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ALDH9A1P49189 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ALDH9A1P49189 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ALDH9A1P49189 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ALDH9A1P49189 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ALDH9A1P49189 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ALDH9A1P49189 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ALDH9A1P49189 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ALDH9A1P49189 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ALDH9A1P49189 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ALDH9A1P49189 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ALDH9A1P49189 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ALDH9A1P49189 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ALDH9A1P49189 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ALDH9A1P49189 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ALDH9A1P49189 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ALDH9A1P49189 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ALDH9A1P49189 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ALDH9A1P49189 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ALDH9A1P49189 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ALDH9A1P49189 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ALDH9A1P49189 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ALDH9A1P49189 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ALDH9A1P49189 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ALDH9A1P49189 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ALDH9A1P49189 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ALDH9A1P49189 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ALDH9A1P49189 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ALDH9A1P49189 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ALDH9A1P49189 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ALDH9A1P49189 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ALDH9A1P49189 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ALDH9A1P49189 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ALDH9A1P49189 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ALDH9A1P49189 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ALDH9A1P49189 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ALDH9A1P49189 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ALDH9A1P49189 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ALDH9A1P49189 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ALDH9A1P49189 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ALDH9A1P49189 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ALDH9A1P49189 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ALDH9A1P49189 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ALDH9A1P49189 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ALDH9A1P49189 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ALDH9A1P49189 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ALDH9A1P49189 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ALDH9A1P49189 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ALDH9A1P49189 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ALDH9A1P49189 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ALDH9A1P49189 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ALDH9A1P49189 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ALDH9A1P49189 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms