Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACADSBP45954 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms