Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNA4P43681 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNA4P43681 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNA4P43681 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNA4P43681 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNA4P43681 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNA4P43681 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNA4P43681 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNA4P43681 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNA4P43681 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNA4P43681 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNA4P43681 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNA4P43681 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNA4P43681 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNA4P43681 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNA4P43681 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNA4P43681 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNA4P43681 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNA4P43681 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNA4P43681 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNA4P43681 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNA4P43681 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNA4P43681 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNA4P43681 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNA4P43681 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNA4P43681 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNA4P43681 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNA4P43681 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNA4P43681 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNA4P43681 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNA4P43681 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CHRNA4P43681 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms