Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIK1P39086 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GRIK1P39086 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK1P39086 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK1P39086 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK1P39086 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK1P39086 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK1P39086 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK1P39086 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK1P39086 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK1P39086 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK1P39086 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK1P39086 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK1P39086 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK1P39086 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK1P39086 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK1P39086 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK1P39086 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK1P39086 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK1P39086 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK1P39086 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK1P39086 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK1P39086 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK1P39086 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK1P39086 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK1P39086 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK1P39086 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK1P39086 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK1P39086 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK1P39086 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK1P39086 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK1P39086 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK1P39086 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK1P39086 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK1P39086 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK1P39086 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK1P39086 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK1P39086 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK1P39086 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GRIK1P39086 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK1P39086 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK1P39086 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK1P39086 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK1P39086 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK1P39086 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK1P39086 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK1P39086 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK1P39086 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK1P39086 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK1P39086 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK1P39086 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK1P39086 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK1P39086 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK1P39086 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK1P39086 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK1P39086 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK1P39086 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK1P39086 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK1P39086 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK1P39086 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK1P39086 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK1P39086 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK1P39086 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK1P39086 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK1P39086 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK1P39086 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK1P39086 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK1P39086 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK1P39086 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK1P39086 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK1P39086 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK1P39086 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK1P39086 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK1P39086 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK1P39086 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK1P39086 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK1P39086 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK1P39086 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK1P39086 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK1P39086 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK1P39086 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK1P39086 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK1P39086 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK1P39086 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK1P39086 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK1P39086 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK1P39086 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK1P39086 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK1P39086 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK1P39086 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK1P39086 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIK1P39086 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIK1P39086 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIK1P39086 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIK1P39086 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIK1P39086 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIK1P39086 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIK1P39086 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIK1P39086 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIK1P39086 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms