Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ITGAEP38570 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms