Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA7P36544 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA7P36544 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA7P36544 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA7P36544 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA7P36544 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA7P36544 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA7P36544 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA7P36544 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA7P36544 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA7P36544 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA7P36544 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA7P36544 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHRNA7P36544 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNA7P36544 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNA7P36544 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNA7P36544 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNA7P36544 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNA7P36544 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNA7P36544 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNA7P36544 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNA7P36544 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNA7P36544 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNA7P36544 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNA7P36544 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNA7P36544 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNA7P36544 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNA7P36544 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNA7P36544 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNA7P36544 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNA7P36544 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNA7P36544 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNA7P36544 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CHRNA7P36544 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CHRNA7P36544 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNA7P36544 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNA7P36544 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CHRNA7P36544 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CHRNA7P36544 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CHRNA7P36544 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CHRNA7P36544 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CHRNA7P36544 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
CHRNA7P36544 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CHRNA7P36544 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CHRNA7P36544 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CHRNA7P36544 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CHRNA7P36544 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CHRNA7P36544 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CHRNA7P36544 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CHRNA7P36544 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CHRNA7P36544 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CHRNA7P36544 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNA7P36544 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNA7P36544 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNA7P36544 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNA7P36544 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNA7P36544 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNA7P36544 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNA7P36544 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNA7P36544 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNA7P36544 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNA7P36544 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNA7P36544 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNA7P36544 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNA7P36544 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNA7P36544 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNA7P36544 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNA7P36544 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNA7P36544 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNA7P36544 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNA7P36544 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNA7P36544 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNA7P36544 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNA7P36544 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNA7P36544 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNA7P36544 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNA7P36544 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNA7P36544 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNA7P36544 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNA7P36544 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNA7P36544 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNA7P36544 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNA7P36544 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNA7P36544 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNA7P36544 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNA7P36544 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNA7P36544 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNA7P36544 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNA7P36544 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CHRNA7P36544 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CHRNA7P36544 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CHRNA7P36544 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CHRNA7P36544 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHRNA7P36544 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CHRNA7P36544 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CHRNA7P36544 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHRNA7P36544 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CHRNA7P36544 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHRNA7P36544 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CHRNA7P36544 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms