Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJA4P35212 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJA4P35212 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJA4P35212 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJA4P35212 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJA4P35212 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJA4P35212 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJA4P35212 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJA4P35212 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJA4P35212 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJA4P35212 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GJA4P35212 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJA4P35212 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJA4P35212 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJA4P35212 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJA4P35212 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJA4P35212 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJA4P35212 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJA4P35212 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJA4P35212 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GJA4P35212 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJA4P35212 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GJA4P35212 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJA4P35212 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJA4P35212 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJA4P35212 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJA4P35212 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GJA4P35212 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GJA4P35212 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJA4P35212 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJA4P35212 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJA4P35212 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJA4P35212 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJA4P35212 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJA4P35212 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJA4P35212 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJA4P35212 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJA4P35212 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJA4P35212 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJA4P35212 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJA4P35212 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJA4P35212 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJA4P35212 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJA4P35212 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJA4P35212 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJA4P35212 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJA4P35212 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJA4P35212 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJA4P35212 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJA4P35212 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJA4P35212 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJA4P35212 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJA4P35212 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJA4P35212 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJA4P35212 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJA4P35212 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GJA4P35212 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJA4P35212 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJA4P35212 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJA4P35212 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJA4P35212 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJA4P35212 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJA4P35212 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJA4P35212 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJA4P35212 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJA4P35212 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJA4P35212 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJA4P35212 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJA4P35212 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJA4P35212 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJA4P35212 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJA4P35212 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJA4P35212 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GJA4P35212 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJA4P35212 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJA4P35212 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJA4P35212 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJA4P35212 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJA4P35212 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJA4P35212 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJA4P35212 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJA4P35212 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJA4P35212 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GJA4P35212 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJA4P35212 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJA4P35212 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJA4P35212 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJA4P35212 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJA4P35212 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJA4P35212 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJA4P35212 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJA4P35212 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJA4P35212 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJA4P35212 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJA4P35212 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJA4P35212 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJA4P35212 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJA4P35212 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJA4P35212 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJA4P35212 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms