Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GPC1P35052 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GPC1P35052 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GPC1P35052 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GPC1P35052 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GPC1P35052 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GPC1P35052 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GPC1P35052 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GPC1P35052 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GPC1P35052 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GPC1P35052 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GPC1P35052 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GPC1P35052 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GPC1P35052 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GPC1P35052 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GPC1P35052 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GPC1P35052 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GPC1P35052 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GPC1P35052 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GPC1P35052 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GPC1P35052 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GPC1P35052 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GPC1P35052 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GPC1P35052 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GPC1P35052 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GPC1P35052 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
GPC1P35052 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPC1P35052 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPC1P35052 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPC1P35052 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPC1P35052 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPC1P35052 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPC1P35052 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPC1P35052 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPC1P35052 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPC1P35052 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPC1P35052 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPC1P35052 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPC1P35052 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPC1P35052 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPC1P35052 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPC1P35052 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPC1P35052 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GPC1P35052 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPC1P35052 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPC1P35052 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPC1P35052 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPC1P35052 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPC1P35052 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPC1P35052 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPC1P35052 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPC1P35052 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPC1P35052 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPC1P35052 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPC1P35052 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPC1P35052 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPC1P35052 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPC1P35052 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPC1P35052 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GPC1P35052 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GPC1P35052 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GPC1P35052 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GPC1P35052 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GPC1P35052 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GPC1P35052 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GPC1P35052 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GPC1P35052 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GPC1P35052 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GPC1P35052 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GPC1P35052 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GPC1P35052 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GPC1P35052 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GPC1P35052 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GPC1P35052 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GPC1P35052 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GPC1P35052 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GPC1P35052 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GPC1P35052 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GPC1P35052 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GPC1P35052 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GPC1P35052 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GPC1P35052 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GPC1P35052 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GPC1P35052 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GPC1P35052 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GPC1P35052 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GPC1P35052 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GPC1P35052 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GPC1P35052 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GPC1P35052 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GPC1P35052 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GPC1P35052 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GPC1P35052 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GPC1P35052 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GPC1P35052 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GPC1P35052 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GPC1P35052 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GPC1P35052 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GPC1P35052 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GPC1P35052 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms