Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CPS1P31327 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CPS1P31327 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CPS1P31327 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CPS1P31327 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CPS1P31327 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CPS1P31327 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CPS1P31327 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CPS1P31327 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CPS1P31327 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CPS1P31327 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CPS1P31327 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CPS1P31327 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CPS1P31327 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CPS1P31327 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CPS1P31327 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CPS1P31327 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CPS1P31327 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CPS1P31327 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CPS1P31327 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CPS1P31327 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CPS1P31327 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CPS1P31327 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CPS1P31327 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CPS1P31327 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CPS1P31327 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CPS1P31327 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CPS1P31327 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CPS1P31327 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CPS1P31327 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CPS1P31327 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CPS1P31327 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CPS1P31327 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CPS1P31327 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CPS1P31327 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CPS1P31327 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CPS1P31327 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CPS1P31327 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CPS1P31327 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CPS1P31327 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CPS1P31327 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CPS1P31327 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CPS1P31327 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CPS1P31327 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CPS1P31327 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CPS1P31327 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CPS1P31327 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CPS1P31327 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CPS1P31327 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CPS1P31327 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CPS1P31327 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CPS1P31327 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CPS1P31327 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CPS1P31327 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CPS1P31327 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CPS1P31327 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CPS1P31327 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CPS1P31327 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CPS1P31327 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CPS1P31327 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CPS1P31327 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CPS1P31327 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CPS1P31327 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CPS1P31327 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CPS1P31327 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CPS1P31327 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CPS1P31327 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CPS1P31327 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CPS1P31327 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CPS1P31327 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CPS1P31327 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CPS1P31327 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CPS1P31327 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CPS1P31327 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CPS1P31327 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CPS1P31327 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CPS1P31327 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CPS1P31327 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CPS1P31327 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CPS1P31327 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CPS1P31327 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CPS1P31327 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CPS1P31327 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CPS1P31327 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CPS1P31327 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CPS1P31327 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CPS1P31327 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CPS1P31327 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CPS1P31327 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CPS1P31327 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CPS1P31327 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CPS1P31327 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CPS1P31327 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CPS1P31327 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CPS1P31327 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CPS1P31327 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CPS1P31327 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CPS1P31327 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CPS1P31327 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CPS1P31327 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms