Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2E1P29083 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms