Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
DUSP1P28562 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.8 ms