Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SSFA2P28290 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms