Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRGP23470 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRGP23470 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRGP23470 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRGP23470 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRGP23470 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRGP23470 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRGP23470 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRGP23470 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRGP23470 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRGP23470 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRGP23470 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRGP23470 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRGP23470 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRGP23470 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRGP23470 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRGP23470 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRGP23470 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRGP23470 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRGP23470 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRGP23470 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRGP23470 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPRGP23470 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPRGP23470 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPRGP23470 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPRGP23470 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPRGP23470 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPRGP23470 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPRGP23470 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPRGP23470 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPRGP23470 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPRGP23470 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPRGP23470 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPRGP23470 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPRGP23470 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPRGP23470 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPRGP23470 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPRGP23470 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPRGP23470 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPRGP23470 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPRGP23470 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPRGP23470 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPRGP23470 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPRGP23470 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPRGP23470 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPRGP23470 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPRGP23470 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPRGP23470 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPRGP23470 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPRGP23470 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPRGP23470 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPRGP23470 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPRGP23470 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPRGP23470 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPRGP23470 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPRGP23470 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPRGP23470 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPRGP23470 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPRGP23470 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPRGP23470 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPRGP23470 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPRGP23470 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPRGP23470 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPRGP23470 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPRGP23470 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTPRGP23470 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTPRGP23470 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTPRGP23470 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
PTPRGP23470 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTPRGP23470 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTPRGP23470 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTPRGP23470 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTPRGP23470 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTPRGP23470 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTPRGP23470 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTPRGP23470 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTPRGP23470 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTPRGP23470 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTPRGP23470 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTPRGP23470 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTPRGP23470 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTPRGP23470 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
PTPRGP23470 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
PTPRGP23470 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTPRGP23470 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTPRGP23470 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTPRGP23470 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTPRGP23470 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PTPRGP23470 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PTPRGP23470 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PTPRGP23470 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PTPRGP23470 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PTPRGP23470 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
PTPRGP23470 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PTPRGP23470 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PTPRGP23470 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PTPRGP23470 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PTPRGP23470 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PTPRGP23470 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PTPRGP23470 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
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