Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRDP23468 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
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