Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPS6KB1P23443 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPS6KB1P23443 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPS6KB1P23443 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPS6KB1P23443 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPS6KB1P23443 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPS6KB1P23443 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPS6KB1P23443 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPS6KB1P23443 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPS6KB1P23443 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPS6KB1P23443 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPS6KB1P23443 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPS6KB1P23443 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPS6KB1P23443 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RPS6KB1P23443 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RPS6KB1P23443 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPS6KB1P23443 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPS6KB1P23443 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPS6KB1P23443 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPS6KB1P23443 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPS6KB1P23443 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPS6KB1P23443 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPS6KB1P23443 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPS6KB1P23443 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPS6KB1P23443 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPS6KB1P23443 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPS6KB1P23443 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPS6KB1P23443 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPS6KB1P23443 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPS6KB1P23443 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPS6KB1P23443 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPS6KB1P23443 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPS6KB1P23443 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPS6KB1P23443 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPS6KB1P23443 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPS6KB1P23443 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPS6KB1P23443 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPS6KB1P23443 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPS6KB1P23443 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPS6KB1P23443 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RPS6KB1P23443 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPS6KB1P23443 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPS6KB1P23443 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPS6KB1P23443 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RPS6KB1P23443 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPS6KB1P23443 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPS6KB1P23443 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPS6KB1P23443 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPS6KB1P23443 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPS6KB1P23443 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPS6KB1P23443 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPS6KB1P23443 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPS6KB1P23443 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RPS6KB1P23443 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPS6KB1P23443 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPS6KB1P23443 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPS6KB1P23443 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPS6KB1P23443 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPS6KB1P23443 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPS6KB1P23443 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPS6KB1P23443 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPS6KB1P23443 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPS6KB1P23443 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPS6KB1P23443 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPS6KB1P23443 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPS6KB1P23443 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPS6KB1P23443 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPS6KB1P23443 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPS6KB1P23443 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RPS6KB1P23443 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPS6KB1P23443 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RPS6KB1P23443 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPS6KB1P23443 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPS6KB1P23443 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPS6KB1P23443 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPS6KB1P23443 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPS6KB1P23443 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPS6KB1P23443 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPS6KB1P23443 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPS6KB1P23443 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPS6KB1P23443 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPS6KB1P23443 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RPS6KB1P23443 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPS6KB1P23443 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPS6KB1P23443 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPS6KB1P23443 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPS6KB1P23443 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPS6KB1P23443 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPS6KB1P23443 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPS6KB1P23443 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPS6KB1P23443 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPS6KB1P23443 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPS6KB1P23443 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPS6KB1P23443 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPS6KB1P23443 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPS6KB1P23443 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPS6KB1P23443 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPS6KB1P23443 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPS6KB1P23443 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPS6KB1P23443 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
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