Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FGFR3P22607 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FGFR3P22607 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FGFR3P22607 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FGFR3P22607 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FGFR3P22607 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
FGFR3P22607 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FGFR3P22607 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FGFR3P22607 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FGFR3P22607 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FGFR3P22607 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FGFR3P22607 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FGFR3P22607 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FGFR3P22607 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FGFR3P22607 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FGFR3P22607 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms