Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCP2P22307 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCP2P22307 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCP2P22307 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCP2P22307 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCP2P22307 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCP2P22307 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SCP2P22307 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SCP2P22307 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCP2P22307 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCP2P22307 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCP2P22307 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCP2P22307 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCP2P22307 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCP2P22307 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCP2P22307 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCP2P22307 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SCP2P22307 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCP2P22307 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SCP2P22307 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SCP2P22307 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCP2P22307 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCP2P22307 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCP2P22307 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCP2P22307 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCP2P22307 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCP2P22307 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCP2P22307 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCP2P22307 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCP2P22307 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCP2P22307 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCP2P22307 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCP2P22307 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCP2P22307 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCP2P22307 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCP2P22307 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCP2P22307 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCP2P22307 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCP2P22307 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCP2P22307 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCP2P22307 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCP2P22307 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCP2P22307 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCP2P22307 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SCP2P22307 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCP2P22307 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCP2P22307 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCP2P22307 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCP2P22307 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCP2P22307 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SCP2P22307 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCP2P22307 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCP2P22307 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCP2P22307 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCP2P22307 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCP2P22307 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCP2P22307 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCP2P22307 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCP2P22307 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCP2P22307 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCP2P22307 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCP2P22307 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCP2P22307 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCP2P22307 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCP2P22307 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCP2P22307 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCP2P22307 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCP2P22307 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SCP2P22307 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCP2P22307 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCP2P22307 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SCP2P22307 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCP2P22307 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCP2P22307 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCP2P22307 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCP2P22307 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCP2P22307 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCP2P22307 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SCP2P22307 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCP2P22307 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCP2P22307 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCP2P22307 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCP2P22307 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCP2P22307 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCP2P22307 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCP2P22307 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCP2P22307 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCP2P22307 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCP2P22307 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCP2P22307 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCP2P22307 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCP2P22307 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCP2P22307 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCP2P22307 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCP2P22307 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SCP2P22307 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCP2P22307 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCP2P22307 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCP2P22307 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCP2P22307 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms