Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EPHA1P21709 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms