Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW5

SMIM10L2B, Small integral membrane protein 10-like protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SMIM10L2BP0DMW5 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SMIM10L2BP0DMW5 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SMIM10L2BP0DMW5 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMIM10L2BP0DMW5 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms