Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPRCP08575 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRCP08575 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
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