Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SRPRAP08240 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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