Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CENPBP07199 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CENPBP07199 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CENPBP07199 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CENPBP07199 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CENPBP07199 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CENPBP07199 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CENPBP07199 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CENPBP07199 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CENPBP07199 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CENPBP07199 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CENPBP07199 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CENPBP07199 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CENPBP07199 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CENPBP07199 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CENPBP07199 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CENPBP07199 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CENPBP07199 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CENPBP07199 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CENPBP07199 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CENPBP07199 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CENPBP07199 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
CENPBP07199 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CENPBP07199 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CENPBP07199 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CENPBP07199 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CENPBP07199 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CENPBP07199 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CENPBP07199 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CENPBP07199 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CENPBP07199 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CENPBP07199 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CENPBP07199 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CENPBP07199 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CENPBP07199 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CENPBP07199 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CENPBP07199 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CENPBP07199 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CENPBP07199 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CENPBP07199 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CENPBP07199 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CENPBP07199 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CENPBP07199 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CENPBP07199 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CENPBP07199 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CENPBP07199 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CENPBP07199 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CENPBP07199 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CENPBP07199 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CENPBP07199 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CENPBP07199 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CENPBP07199 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CENPBP07199 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CENPBP07199 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CENPBP07199 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CENPBP07199 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CENPBP07199 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CENPBP07199 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CENPBP07199 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CENPBP07199 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CENPBP07199 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CENPBP07199 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CENPBP07199 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CENPBP07199 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CENPBP07199 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CENPBP07199 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CENPBP07199 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CENPBP07199 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CENPBP07199 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CENPBP07199 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CENPBP07199 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CENPBP07199 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CENPBP07199 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CENPBP07199 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CENPBP07199 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CENPBP07199 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CENPBP07199 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CENPBP07199 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CENPBP07199 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CENPBP07199 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CENPBP07199 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CENPBP07199 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CENPBP07199 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CENPBP07199 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CENPBP07199 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CENPBP07199 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CENPBP07199 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CENPBP07199 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CENPBP07199 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CENPBP07199 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CENPBP07199 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CENPBP07199 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CENPBP07199 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CENPBP07199 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CENPBP07199 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CENPBP07199 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CENPBP07199 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CENPBP07199 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CENPBP07199 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CENPBP07199 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms