Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC1P02654 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC1P02654 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC1P02654 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC1P02654 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC1P02654 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC1P02654 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC1P02654 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC1P02654 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC1P02654 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC1P02654 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC1P02654 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC1P02654 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC1P02654 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC1P02654 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC1P02654 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC1P02654 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC1P02654 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC1P02654 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC1P02654 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC1P02654 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC1P02654 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC1P02654 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC1P02654 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
APOC1P02654 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC1P02654 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC1P02654 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC1P02654 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC1P02654 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC1P02654 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC1P02654 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC1P02654 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC1P02654 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC1P02654 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC1P02654 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC1P02654 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC1P02654 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC1P02654 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC1P02654 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC1P02654 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC1P02654 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC1P02654 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC1P02654 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC1P02654 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC1P02654 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC1P02654 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC1P02654 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC1P02654 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC1P02654 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC1P02654 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC1P02654 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC1P02654 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC1P02654 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC1P02654 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC1P02654 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC1P02654 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC1P02654 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC1P02654 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC1P02654 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC1P02654 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC1P02654 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC1P02654 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC1P02654 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC1P02654 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC1P02654 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC1P02654 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC1P02654 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC1P02654 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC1P02654 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
APOC1P02654 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC1P02654 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC1P02654 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC1P02654 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC1P02654 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC1P02654 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC1P02654 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC1P02654 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC1P02654 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC1P02654 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC1P02654 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC1P02654 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC1P02654 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC1P02654 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC1P02654 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC1P02654 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC1P02654 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC1P02654 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC1P02654 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC1P02654 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC1P02654 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC1P02654 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC1P02654 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC1P02654 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC1P02654 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC1P02654 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC1P02654 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC1P02654 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC1P02654 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC1P02654 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
APOC1P02654 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms