Protein–RNA interactions for Protein: O95471

CLDN7, Claudin-7, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN7O95471 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN7O95471 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN7O95471 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN7O95471 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN7O95471 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN7O95471 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN7O95471 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN7O95471 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN7O95471 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN7O95471 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN7O95471 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN7O95471 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN7O95471 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN7O95471 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN7O95471 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN7O95471 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN7O95471 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN7O95471 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN7O95471 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN7O95471 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN7O95471 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN7O95471 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN7O95471 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN7O95471 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN7O95471 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN7O95471 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN7O95471 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN7O95471 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN7O95471 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN7O95471 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN7O95471 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN7O95471 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN7O95471 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN7O95471 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN7O95471 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN7O95471 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLDN7O95471 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN7O95471 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN7O95471 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN7O95471 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN7O95471 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN7O95471 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN7O95471 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN7O95471 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN7O95471 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN7O95471 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN7O95471 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN7O95471 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN7O95471 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN7O95471 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN7O95471 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN7O95471 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN7O95471 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN7O95471 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN7O95471 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN7O95471 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN7O95471 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN7O95471 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN7O95471 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN7O95471 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN7O95471 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN7O95471 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN7O95471 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN7O95471 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN7O95471 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN7O95471 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN7O95471 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN7O95471 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN7O95471 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN7O95471 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN7O95471 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN7O95471 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN7O95471 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN7O95471 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN7O95471 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN7O95471 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN7O95471 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN7O95471 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN7O95471 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN7O95471 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN7O95471 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN7O95471 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN7O95471 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN7O95471 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN7O95471 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN7O95471 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN7O95471 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN7O95471 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN7O95471 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN7O95471 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN7O95471 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN7O95471 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN7O95471 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN7O95471 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN7O95471 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN7O95471 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN7O95471 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN7O95471 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN7O95471 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN7O95471 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms